Релігійна громада Церкви у Чернігові розпочала свою діяльність восени 1997 року. У місті вже проживали члени Церкви, які раніше їздили до Києва на богослужіння. Громаду офіційно зареєстрували 24 листопада 1997 року. Також було утворено Чернігівську філію у складі Київської місії.